Työpaketti 4 (WP4): Parhaat menetelmät maaperän biologisen monimuotoisuuden arviointiin
Tavoite on osallistua maaperän biologisen monimuotoisuuden arviointimenetelmien meneillään olevaan kehitystyöhön.
Erityiset tavoitteet ovat seuraavat:
- Toteuttaa ja edelleen optimoida uusi korkean suorituskyvyn kvantitatiivinen PCR (HT-qPCR) -siru 64 sellaisen mikrobitoiminnallisen geenin samanaikaiseen kvantifiointiin, joilla on ratkaiseva merkitys maaperän sisältämän hiilen, typen, fosforin ja rikin biogeokemialliseen kiertoon.
- Toteuttaa ja edelleen optimoida testit maaperässä olevien sukkulamatojen monimuotoisuuden määrittämiseksi molekyylibiologisin menetelmän (uuden sukupolven sekvensointiin perustuva DNA-metaviivakoodimenetelmä) toteuttamisen avulla.
- Optimoida Fourier-muunnosinfrapunaspektroskopiaan perustuva kemometrinen menetelmä maaperän biologisessa monimuotoisuudessa tapahtuvien muutosten seuraamiseksi korkealla suorituskyvyllä.
