Werkpakket 4 (WP4): Beste methoden voor de evaluatie van de biodiversiteit in de bodem
In WP4 ontwikkelen we nieuwe methoden en bijhorende protocollen om de biodiversiteit in de bodem te beoordelen.
De specifieke doelstellingen zijn:
- Implementeren en verder optimaliseren van een nieuwe high-throughput kwantitatieve PCR (HT-qPCR) chip voor de gelijktijdige kwantificering van 64 functionele microbiële genen die van cruciaal belang zijn voor de biogeochemische cycli van C, N, P en S in de bodem.
- Implementeren en verder optimaliseren van tests om de biodiversiteit van nematoden in bodems te bepalen via een moleculaire methode (NGS-gebaseerde DNA-metabarcoding).
- Optimaliseren van een op FTIR-spectroscopie gebaseerde chemometrische benadering voor high-throughput monitoring van veranderingen in bodembiodiversiteit.
